位於屋久島內陸、古北區系與東洋區系（palaearctic and oriental biotic regions）交界點的屋久島，蘊含有1900種與亞種的豐富植物生態，包含古代杉木標本(日本杉)以及此區獨有的溫帶古森林遺跡。在屋久島內樹齡超過1000年以上便被稱為屋久杉，島內樹齡最老的為7200年之繩文杉。除了珍貴的植物生態外亦有一些特有的哺乳類與瀕臨絕種的鳥類生息於此。